Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms