Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VdrP48281 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VdrP48281 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
VdrP48281 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VdrP48281 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms