Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nedd4P46935 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd4P46935 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd4P46935 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms