Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp4P35123 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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