Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Saa4P31532 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms