Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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