Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RxraP28700 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RxraP28700 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxraP28700 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms