Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NapbP28663 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NapbP28663 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NapbP28663 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NapbP28663 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NapbP28663 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NapbP28663 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NapbP28663 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NapbP28663 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms