Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pde6aP27664 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pde6aP27664 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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