Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb2P27090 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb2P27090 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms