Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RarbP22605 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RarbP22605 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RarbP22605 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RarbP22605 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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