Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P18532 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18532 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18532 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18532 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms