Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18530 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18530 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18530 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms