Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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PtpraP18052 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpraP18052 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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