Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcnaP17918 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcnaP17918 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms