Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim30aP15533 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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