Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sub1P11031 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms