Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PolP10400 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PolP10400 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PolP10400 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PolP10400 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PolP10400 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PolP10400 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PolP10400 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PolP10400 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PolP10400 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PolP10400 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PolP10400 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PolP10400 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms