Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms