Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna5P07349 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms