Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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