Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tcn2O88968 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms