Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms