Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DffaO54786 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffaO54786 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DffaO54786 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DffaO54786 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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