Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CrxO54751 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CrxO54751 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CrxO54751 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms