Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cited2O35740 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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