Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MttpO08601 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MttpO08601 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MttpO08601 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MttpO08601 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MttpO08601 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
MttpO08601 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MttpO08601 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MttpO08601 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms