Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2888K7N746 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms