Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm379J3QQ19 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms