Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem200cJ3QK46 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms