Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20828J3KMI7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms