Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmod3E9QA62 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms