Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cfap46E9Q2C0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cfap46E9Q2C0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cfap46E9Q2C0 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cfap46E9Q2C0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cfap46E9Q2C0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cfap46E9Q2C0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cfap46E9Q2C0 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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