Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rdh8D3Z6W3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms