Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms