Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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