Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms