Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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