Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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