Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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