Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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