Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms