Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms