Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Snx1Q9WV80 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Snx1Q9WV80 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx1Q9WV80 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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