Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trpc2Q9R244 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms