Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms