Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Tnnt3Q9QZ47 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Tnnt3Q9QZ47 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Tnnt3Q9QZ47 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Tnnt3Q9QZ47 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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