Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms