Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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