Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cabp1Q9JLK7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms